NVIDIA đã công bố phát hành Clara Parabricks mới của mình 3.7 mang lại quy trình làm việc được tối ưu hóa và tăng tốc cho các bảng gen. Bản phát hành mới nhất hiện bao gồm hơn 50 công cụ cung cấp cho các nhà nghiên cứu khả năng phân tích bộ gen chính xác và nhanh chóng cho các bảng gen, bộ gen và bộ gen cho quy trình nghiên cứu và lâm sàng.
Các tính năng mới có trong phiên bản mới nhất của Clara Parabricks 3.7 bao gồm khả năng tăng tốc và đơn giản hóa quy trình làm việc của bảng gen với sự hỗ trợ của Mã định danh phân tử duy nhất (UMI) còn được gọi là mã vạch phân tử, hỗ trợ RNA-Seq cho quy trình làm việc phiên mã với công cụ gọi tổng hợp gen thứ hai Arriba và công cụ định lượng RNA-Seq Kallisto cũng như công cụ định lượng RNA-Seq ngắn hạn. phát hiện lặp lại song song (STR) với ExpansionHunter. Cùng với việc tích hợp các phiên bản mới nhất của trình gọi dòng mầm DeepVariant v1.1 và GATK v4.2 với HaplotypeCaller và công cụ BAM2FASTQ được tăng tốc gấp 10 lần để chuyển đổi dữ liệu đã lưu trữ được lưu trữ dưới dạng tệp BAM hoặc CRAM trở lại FASTQ. Bộ dữ liệu có thể được cập nhật bằng cách căn chỉnh theo các tài liệu tham khảo mới và được cải tiến.
NVIDIA Clara Parabricks v3.7 phát hành
Để biết thêm thông tin về Clara Parabricks v3.7 và cách nó có thể giúp tối ưu hóa và tăng tốc quy trình làm việc cho bảng gen, hãy chuyển sang thông cáo báo chí chính thức của NVIDIA bằng cách nhấp vào liên kết bên dưới.
nguồn : NVIDIA
Tuyên bố từ chối trách nhiệm: Một số bài viết của chúng tôi bao gồm các liên kết liên kết. Nếu bạn mua thứ gì đó thông qua một trong những liên kết này, APS Blog có thể kiếm được hoa hồng liên kết. Tìm hiểu về Chính sách tiết lộ của chúng tôi.
